冷凍倉庫の入出庫はどう進む？
締め時間と期替りの集中を避ける

冷凍倉庫の入出庫は、荷主が指図を出し、倉庫会社が庫入・庫出を行う形で進みます。標準冷蔵倉庫寄託約款は「貨物の庫入及び庫出その他の作業は、全て当会社が行う」と定めており、荷主が自分で庫内に入って作業するものではありません。

実務で問題になりやすいのは、締め時間、期替りの物量集中、温度が上がる場面、そして検品の範囲です。国土交通省の倉庫統計季報によれば、冷蔵倉庫の入庫高は令和7年6月で2,140千トン、保管残高は4,197千トンありました。この記事では、流れの各段階で荷主が決めておくべきことを、約款と協会資料にあたって整理します。

目次

1. 冷凍倉庫の入出庫は5つの段階に分かれる
2. 入出庫の指図は締め時間までに出す
3. 入出庫が期替りに集中する理由
4. 冷凍倉庫の入出庫で温度が上がる場面
5. 入出庫にかかる荷役料と附帯作業
6. 入出庫の検品は外観のみが原則
7. 冷凍倉庫の入出庫を支えるシステム
8. 冷凍倉庫の入出庫の実務チェック
   1. この記事を書いた人
9. 冷凍倉庫の入出庫に関するよくある質問

冷凍倉庫の入出庫は5つの段階に分かれる

冷凍倉庫の入出庫とは、荷物を冷蔵室へ入れる庫入と、冷蔵室から出す庫出の一連の作業です。寄託契約では、この作業を倉庫会社が行います。

段階の整理は新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第3条・第4条・第14条・第19条と、掲載10社のサービス説明から作成（2026年9月12日確認）。

この5段階のうち、荷主が主導権を持つのは①と、④⑤の条件決めです。ほかは倉庫会社の作業になります。だからこそ、契約の段階で条件を詰めておくかどうかで運用の負担が変わります。

入出庫の指図は締め時間までに出す

締め時間を守れないと費用が増えます。新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第4条第2項は「当会社は、十分な時間的余裕のない入出庫指図及び指図の取消しが発生した場合には別途費用を請求することができる」と定めています。

この条文は2026年4月1日施行の改正で明文化されたものです。直前の指図変更や取消しが有償になりうる点は、旧約款より踏み込んだ規定といえます。締め時間そのものは約款に書かれておらず、倉庫ごとの運用で決まります。

契約前に確認しておきたいのは次の項目です。

• 当日出庫の締め時間と、翌日出庫の締め時間
• 土日祝の受付可否と、年末年始の運用
• 指図の手段（WMSの画面、EDI、FAX、メール）と受付の確認方法
• 取消し・数量変更が有償になる線引き

費目の全体像は冷凍倉庫の保管料の相場で整理しています。

入出庫が期替りに集中する理由

冷蔵倉庫の入出庫には、月の特定の日に物量が偏るという構造的な問題があります。原因は保管料の計算方法です。

日本冷蔵倉庫協会は「多くの冷蔵倉庫が『暦日１ヶ月２期制』で保管料を収受していますので、上下期替り（15日/16日）と月末月初（月末/1日）で入出庫が集中します」と説明しています。さらに「例えば、月末最終日に入庫すると下期分として１期分の請求が発生します。期をまたぐと２期分の請求が発生するので、入庫は期替りの直後、出庫は期替りの直前に集中します」と、行動の理由まで書いています。

日本冷蔵倉庫協会の自主行動計画（日冷倉協第50号・平成29年6月30日）の記載から整理（2026年9月12日確認）。

協会は改善策として「期替りの物量集中を避けるため、暦日２期制の既成概念から脱却し、多様な料金体系を導入する。例：入庫日起算１５日１期制 など」を挙げています。入庫日起算の料金体系を選べる倉庫であれば、入出庫のタイミングを物流の都合で決められます。計算の仕組みは保管料の計算方法で式まで解説しています。

冷凍倉庫の入出庫で温度が上がる場面

庫内の温度が保たれていても、荷物の品温が上がる瞬間があります。入出庫はその代表で、扉の開閉とバースでの滞留が重なる場面です。

厚生労働省が公表する冷蔵倉庫業版のHACCP手引書は、危害要因として「温度上昇による微生物の増殖（生物的危害要因）」を挙げ、管理項目に「設定温度の保持、温度記録計による監視」を示しています。そのうえで「冷蔵倉庫業では各危害要因に対し、以下のような管理手段で対応しているのでＣＣＰを設定する必要はありません」としています。

冷凍・冷蔵倉庫業はHACCPに沿った衛生管理の対象です。厚生労働省は対象外の営業として「食品又は添加物の貯蔵又は運搬のみする営業」を挙げつつ、括弧書きで「ただし、冷凍・冷蔵倉庫業は除く」と明記しています。手引書の作成団体は日本冷蔵倉庫協会です。食品衛生法の届出の区分と、庫内で働く人にかかわる法律は冷凍倉庫の作業に関わる法律の記事で条文から整理しています。

荷主として確認しておく項目は次のとおりです。

• 温度記録の取り方（記録計の種類、記録間隔、保存期間）
• 逸脱が起きたときの連絡の基準と経路
• バースの温度管理（ドックシェルターの有無、前室の有無）
• 温度帯を変える作業に対応できるか

掲載10社では、鴻池運輸とSBSフレックが冷凍から冷蔵への温度帯変更に対応すると公表しています。温度級の指定は冷凍倉庫の温度で扱っています。

入出庫にかかる荷役料と附帯作業

入出庫の費用は保管料と別立てです。倉庫業法施行規則 第24条は料金の種別として「倉庫保管料及び倉庫荷役料その他の営業に関する料金」を挙げており、荷役料は独立した料金種別として届け出られます。

ただし荷役料そのものを定義した条文は、法令にも約款にもありません。読み取れるのは約款の構造からです。第3条が「貨物の庫入及び庫出その他の作業は、全て当会社が行う」とし、第4条が「通常倉庫業務（保管、庫入庫出）に附帯する業務」を別料金としているため、庫入・庫出は荷役料、それ以外の作業は附帯業務料という切り分けになります。

新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）と倉庫業法施行規則を2026年9月12日に確認。旧約款を使う倉庫では条番号が異なります。

掲載10社のうちSBSフレックは、ケース単位からバラ単位までの入出庫に対応し、詰め合わせ・ラベル貼付・店舗別ピッキング、クロスドックまで受けると公表しています。作業の粒度が細かくなるほど附帯業務料の比重が上がるため、見積もりでは作業ごとの単価を出してもらってください。

入出庫の検品は外観のみが原則

入庫時に中身まで確認してもらえると考えていると、行き違いが起きます。新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第14条は「当会社は、入庫に当たり積付け外観のみ検査し、受寄物の内容について検査を行わない」と定めています。

中身の検品が必要なら、第4条の附帯業務として全数検品や開梱検品を別途依頼する形になります。標準の入庫作業に中身の検査は含まれていないという前提で、どこまでを倉庫に任せるかを決めてください。

混合保管についても定めがあります。第19条は「保管室温度帯、貨物の品名と単量、荷造りの種類及び記号・規格又はそれらに相当する事項が同一の受寄物を混合保管することができる」としています。ロットの区別が必要な荷物は、混合保管の対象にしない取り決めが要ります。

冷凍倉庫の入出庫を支えるシステム

在庫の照会と指図をどこで行うかは、日々の手間に直結します。掲載10社では、自社のWMS（倉庫管理システム）を公表している会社があります。

各社公式サイトの記載（2026年9月12日確認）。掲載10社のうち自社システムの名称を公表しているのは3社でした。

確認したいのは、画面が見られるかどうかだけではありません。自社の基幹システムとどうつなぐか、データの形式は何か、リードタイムはどれくらいかまで詰めておくと、切り替え後の負担が読めます。

冷凍倉庫の入出庫の実務チェック

ここまでの内容を、問い合わせのときに聞く順番としてまとめます。上から順に確認すると、見積もりの前提が揃います。

1. 締め時間と指図の手段——当日出庫と翌日出庫、土日祝の運用、取消しが有償になる線引き。
2. 料金体系の期制——暦日2期制か、入庫日起算か。計算方法で請求額が変わります。
3. 検品の範囲——外観のみか、全数検品を附帯で頼むか。
4. 混合保管の可否——ロットを分けたい荷物があるか。
5. 温度記録の出し方——記録間隔、保存期間、荷主が受け取れる形式。
6. パレットの規格——souco は縦横110cm以内・高さ150cm以内・750kg以下を条件として公表しています。
7. システム連携——WMSの画面、データ形式、基幹システムとの接続。

預け先の候補は掲載10社の比較表から絞り込めます。地域で探す場合は東京や大阪などの都道府県ページ、契約の形から入る場合は倉庫の寄託契約をご覧ください。

冷凍倉庫の入出庫に関するよくある質問

冷凍倉庫の入出庫は誰が作業しますか？

寄託契約では倉庫会社が行います。新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第3条が「貨物の庫入及び庫出その他の作業は、全て当会社が行う」と定めているためです。荷主は入出庫の指図を出す側になります。区画を借りる賃貸借契約の場合は、借り手または借り手の委託先が作業を担います。

入出庫の締め時間を過ぎるとどうなりますか？

別途費用が発生する場合があります。新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第4条第2項は「十分な時間的余裕のない入出庫指図及び指図の取消しが発生した場合には別途費用を請求することができる」と定めています。締め時間そのものは約款ではなく倉庫ごとの運用で決まるため、当日出庫・翌日出庫それぞれの時刻を契約前に確認してください。

入出庫が月末と15日に集中するのはなぜですか？

保管料が暦日1か月2期制で計算される倉庫が多いためです。日本冷蔵倉庫協会は、上下期替り（15日/16日）と月末月初（月末/1日）で入出庫が集中すると説明しています。期をまたぐと2期分の請求になるため、入庫は期替りの直後、出庫は期替りの直前に寄りやすくなります。入庫日起算の料金体系を選べれば、この偏りを避けられます。

入庫のときに中身まで検品してもらえますか？

標準では行われません。新標準冷蔵倉庫寄託約款（乙）第14条は「当会社は、入庫に当たり積付け外観のみ検査し、受寄物の内容について検査を行わない」と定めています。全数検品や開梱検品が必要な場合は、第4条の附帯業務として別途依頼し、料金も別に発生する形になります。