超低温の冷凍倉庫は、保管温度が−35℃以下の冷蔵室（SF級）を持つ倉庫です。国土交通省の告示では、令和6年4月1日施行の改正でSF1級からSF4級までの4区分が設けられました。
超低温の室は地域に偏っています。日本冷蔵倉庫協会の会員の冷蔵倉庫で、SF級は所管容積の5.1%です。静岡県は容積の57.3%がSF級で、SF級の冷蔵室を持つ事業所が52あります（2025年12月31日現在）。
このページでは、超低温の室を公式サイトで公開していた5社の比較と、SF級の区分と地域ごとの規模、預ける前に確かめる室の温度・空き状況・凍結の能力・保税・保管料の割増を整理します。
目次
超低温の冷凍保管に対応する冷凍倉庫会社5選
この用途への対応を公式サイトで確認できた冷凍倉庫会社5社です。掲載順は順位ではありません（順不同）。記載根拠はこの下の表にまとめています。選定の考え方は掲載・選定基準をご覧ください。
| 会社名 | 本社・拠点 | 公式サイトで確認できる対応品目 | サービスの型・温度帯 | 料金の公表 |
|---|---|---|---|---|
| 横浜冷凍株式会社 | 神奈川県横浜市西区（本社）／全国の冷蔵倉庫拠点 | 原料・冷凍食品などの食品（水産品・畜産品の輸入を扱う食品販売事業も併営） | 寄託（冷蔵倉庫での保管・仕分・入庫・凍結・出庫）。温度級はC3級〜SF4級で、拠点ごとの室別保管温度をPDFで公開 | — |
| Umios ロジ株式会社 | 東京都中央区（本社）／関東・中部・関西・九州の物流センター | 水産品・畜産品・農産品・冷凍食品 | 寄託（冷蔵倉庫業）。温度級はC3〜SF4で、冷蔵室ごとの保管温度・容積・収容能力をPDFで公開。最も低い室は−60℃ | — |
| 株式会社SIC LOGITEC（旧 焼津冷凍） | 静岡県藤枝市（本社） | 超低温：マグロ・カツオ・カジキ・その他加工品／冷凍・冷蔵：食品（肉類・魚介類・加工食品・野菜・果物）、日用雑貨。冷凍倉庫サービスは食品・医薬品・化学品などと記載 | 寄託。超低温 -60℃（SF4）／冷凍 -25℃前後（F2）／冷蔵 10℃前後（C3）／常温。4温度帯保管と記載 | — |
| 株式会社兵食 | 兵庫県神戸市（本社） | 保管品目の一覧は公式で確認できず。五突・八突は乳製品等指定保管倉庫、全7庫が動物検疫指定倉庫。食品加工（市川冷蔵庫・グループのエッチ・ケー食品）で輸入10kgバルクの2kgリパック等 | 寄託。拠点案内の温度帯表：F2級（−24〜−30℃）、F1級（−18〜−24℃）、C2級（−2〜−10℃）、C3級（-2〜10℃）、ドライ、凍結。各庫の冷蔵設備はF級-25℃・C級0℃。五突冷蔵庫にSF級-55℃（アンモニア冷媒、収容1,000t） | — |
| 門司冷凍製氷株式会社 | 福岡県北九州市（本社） | 冷凍魚、野菜、冷凍食品、冷凍貨物（本社工場）、冷凍魚（市場工場）、冷凍魚・野菜・天津甘栗（葛葉埠頭工場）。貸室は生鮮品・冷凍品・加工品・工業薬品にも使える。危険物・重量物は不可 | 寄託。公式FAQ「0℃から-40℃までカバー」。本社工場 F級（一部C級）、市場工場 SF級・F級・C級、葛葉埠頭工場 F級・C級（2001年に1室を定温倉庫に切替）。貸室の設定可能温度：本社16号・19号 0℃～-20℃、葛葉57号 +5℃～+20℃。協会データ：市場工場にF3・F4（-40℃以下）600㎥ | ◯ |
横浜冷凍株式会社
全国に冷蔵倉庫を持つ事業者で、拠点ごとに冷蔵室別の保管温度（温度級）をPDFで公開しています。多くの室はF1級ですが、C1〜C3級の冷蔵室や、SF級の超低温室を持つ拠点もあり、預けたい品目の温度帯に合う拠点を事前に絞り込めます。保税倉庫での一時保管と通関にも対応しています。
この会社の特徴
- 冷蔵室ごとの温度級を公開——拠点ごとの室別保管温度のPDFで、C3級からSF4級までの区分を示しています。SF級の室は横浜物流センター・北港物流センター・大井川物流センターなどにあります（2026年9月12日確認）。
- 保税と通関に対応——保税倉庫での一時保管に加え、通関の営業拠点を上位6港（東京・横浜・名古屋・大阪・神戸・博多）に置いています。
- 入出庫と在庫をWebで確認——自社開発のシステム（YIS）で、入出庫・在庫・保税貨物の通関状況をWebで確認できると案内しています。
拠点とサービスの内容
| 所在地 | 横浜市西区みなとみらい三丁目3番3号 横浜コネクトスクエア10F |
|---|---|
| 拠点のある地域 | 冷蔵倉庫のある19都道府県（冷蔵倉庫拠点一覧から当サイト集計） |
| 対応品目 | 原料・冷凍食品などの食品（水産品・畜産品の輸入を扱う食品販売事業も併営） |
| サービスの型・温度帯 | 寄託（冷蔵倉庫での保管・仕分・入庫・凍結・出庫）。温度級はC3級〜SF4級で、拠点ごとの室別保管温度をPDFで公開 |
| 拠点数・設備能力 | 国内の冷蔵倉庫拠点56か所（公式の冷蔵倉庫拠点一覧から当サイト集計・海外2社を除く） |
| 料金の公表 | 非公表（公式サイトに料金の記載を確認できず） |
こんな人に向いています：冷凍食品や輸入原料を、温度級を指定して港湾部の拠点に預けたい企業
超低温の冷凍保管で確認したいこと：料金と、保管の最低単位・短期利用は公式サイトで確認できませんでした。配送は自社トラックを持たず協力運送会社を手配する形のため、配送の範囲と費用の扱いを確認してください。拠点数は公式の「早わかりヨコレイ」が57（2026年8月現在）としているのに対し、拠点一覧の国内拠点は当サイトの集計で56件でした。
Umios ロジ株式会社
2026年3月に株式会社マルハニチロ物流から社名を変えた低温物流の事業者です。主要都市の港湾地区を中心に冷蔵倉庫を持ち、倉庫の種類と冷蔵室ごとの保管温度・容積・収容能力を一覧で公開しています。成田事業所の−60℃室をはじめ、SF4級（−50℃以下）の超低温室を持つ拠点があります。
この会社の特徴
- 冷蔵室ごとの温度・容積・収容能力を公開——保管温度の一覧PDFに、拠点別・冷蔵室別の保管温度（運輸局に届け出ている最低温度）と容積・収容能力が載っています。
- 超低温（SF4級）の室を持つ拠点がある——成田事業所に−60℃、川崎第二物流センターに−55℃、築港物流センターに−50℃の室があります（2026年9月12日確認）。
- 通関の手続きにも対応——通関事業のページで、NACCSを使った税関手続きなどの保税処理を案内しています。
拠点とサービスの内容
| 所在地 | 東京都中央区豊海町4-5 豊海振興ビル6階 |
|---|---|
| 拠点のある地域 | 物流センター・事業所のある13都府県（事業所一覧PDFから当サイト集計） |
| 対応品目 | 水産品・畜産品・農産品・冷凍食品 |
| サービスの型・温度帯 | 寄託（冷蔵倉庫業）。温度級はC3〜SF4で、冷蔵室ごとの保管温度・容積・収容能力をPDFで公開。最も低い室は−60℃ |
| 拠点数・設備能力 | 「東京・大阪・名古屋・福岡など主要都市の港湾地区を中心に約62万トンの冷蔵保管能力」（トップメッセージ） |
| 料金の公表 | 非公表（公式サイトに料金の記載を確認できず） |
こんな人に向いています：マグロなどの水産物や輸入の畜産品を、超低温を含む温度級を指定して預けたい企業
超低温の冷凍保管で確認したいこと：料金と、保管の最低単位・短期利用は公式サイトで確認できませんでした。北海道・東北（宮城以外）・中国（山口以外）・四国には拠点がないため、預けたい地域の拠点を事業所一覧で確認してください。
株式会社SIC LOGITEC（旧 焼津冷凍）
藤枝市に本社を置く低温物流会社で、2025年10月の設立50周年を機に焼津冷凍から社名を変えました。マグロ・カツオ向けの-60℃超低温倉庫を県中部に2拠点（合計17,600トン）持ち、取引実績は100社と記載しています。藤枝第一センターでは-25℃前後の冷凍と10℃前後の冷蔵で肉・魚・加工食品・野菜などを預かり、WMSでロット・賞味期限を管理しています。EC向けの出荷代行も行っています。
この会社の特徴
- -60℃の超低温——マグロ・カツオなど水産物の長期保管向けに-60℃（SF4）の倉庫を2拠点で運営しています。
- 4温度帯——超低温・冷凍（-25℃前後）・冷蔵（10℃前後）・常温に対応しています。
- ロット・期限管理——WMSで在庫をリアルタイム管理し、製造ロットごとの管理や先入先出・期限優先出庫に対応しています。
拠点とサービスの内容
| 所在地 | 静岡県藤枝市上当間854番地 |
|---|---|
| 拠点のある地域 | 静岡県に冷凍・冷蔵の拠点 |
| 対応品目 | 超低温：マグロ・カツオ・カジキ・その他加工品／冷凍・冷蔵：食品（肉類・魚介類・加工食品・野菜・果物）、日用雑貨。冷凍倉庫サービスは食品・医薬品・化学品などと記載 |
| サービスの型・温度帯 | 寄託。超低温 -60℃（SF4）／冷凍 -25℃前後（F2）／冷蔵 10℃前後（C3）／常温。4温度帯保管と記載 |
| 拠点数・設備能力 | 超低温倉庫：県中部2拠点で合計17,600トン（藤枝センター 5,410BOX、吉田センター 1,700BOX）／藤枝第一センター（冷凍・冷蔵）1,900パレット |
| 料金の公表 | 非公表（公式サイトに料金の記載を確認できず） |
こんな人に向いています：マグロ・カツオなど超低温が要る水産品の荷主に向いています。静岡県中部で冷凍・冷蔵食品をロット管理つきで預け、EC出荷も任せたい荷主にも向いています。
超低温の冷凍保管で確認したいこと：吉田センターの稼働状況（公式は「2026年春 稼働開始」と記載）、料金・最小ロット、食品衛生の認証（公式で確認できず）を確認してください。
株式会社兵食
1948年設立の神戸の冷蔵倉庫会社で、神戸港の第五〜第八突堤、六甲アイランド、深江浜（東部）、尼崎に計7庫を持っています（千葉県市川を含め8拠点・合計178,500t）。五突冷蔵庫には-55℃のSF級室（1,000t）があります。全庫が保税蔵置場・動物検疫指定倉庫で、特定保税承認者・認定通関業者として通関、海上輸送、全国配送まで自社で扱い、ISO22000を県内6庫で取得しています。
この会社の特徴
- 神戸港の突堤に集中——第五〜第八突堤と六甲アイランド・深江浜・尼崎に7庫あります。港で揚げた輸入品をすぐ入庫できます。
- 超低温と自動倉庫——五突に-55℃のSF級室（1,000t）があります。五突・八突・尼崎には立体自動倉庫を備えています。
- AEOとISO22000——特定保税承認者・認定通関業者です。ISO22000を県内6庫と市川で取得しています。
拠点とサービスの内容
| 所在地 | 兵庫県神戸市中央区小野浜町13番1号 |
|---|---|
| 拠点のある地域 | 兵庫県に冷凍・冷蔵の拠点 |
| 対応品目 | 保管品目の一覧は公式で確認できず。五突・八突は乳製品等指定保管倉庫、全7庫が動物検疫指定倉庫。食品加工（市川冷蔵庫・グループのエッチ・ケー食品）で輸入10kgバルクの2kgリパック等 |
| サービスの型・温度帯 | 寄託。拠点案内の温度帯表：F2級（−24〜−30℃）、F1級（−18〜−24℃）、C2級（−2〜−10℃）、C3級（-2〜10℃）、ドライ、凍結。各庫の冷蔵設備はF級-25℃・C級0℃。五突冷蔵庫にSF級-55℃（アンモニア冷媒、収容1,000t） |
| 拠点数・設備能力 | 公式「8拠点、合計178,500トン」（千葉県の市川冷蔵庫を含む）。兵庫県内7庫：五突28,000t（C級2,000・F級25,000・SF級1,000）、六突13,000t（C1,000・F12,000）、七突8,000t（F）、八突28,000t（C3,000・F25,000、凍結10t/日）、六甲アイランド30,000t（C2,500・F27,500）、東部13,000t（F）、尼崎36,000t（C2,700・F33,300、凍結40t/日）。県内7庫の合計156,000t（当方集計） |
| 料金の公表 | 非公表（公式サイトに料金の記載を確認できず） |
こんな人に向いています：神戸港で輸入する冷凍食品・畜産品・乳製品を通関から保管・配送まで一括で任せたい大口の荷主、超低温保管が必要な荷主に向いています。
超低温の冷凍保管で確認したいこと：料金・最低ロット・短期可否、得意品目、拠点案内の温度帯表と各庫の設備欄の記載差（八突の凍結の有無など）を確認してください。
門司冷凍製氷株式会社
1934年設立、北九州市で冷凍・冷蔵・定温倉庫と製氷を営む地場企業です。門司区の本社工場、北九州市中央卸売市場内の市場工場（SF級240tを含む6,354t）、門司港葛葉埠頭の工場の3拠点で、0℃〜-40℃に対応します。24時間365日自分で出し入れできる貸室を月額（例：本社16号倉庫 月8万円・応相談・税別）で公開しており、少量を自分で管理しながら冷やしたい事業者に向いています。
この会社の特徴
- 貸室の料金を公開——貸倉庫ページで本社16号 月8万円、19号 月14万円、葛葉57号 月5万円（税別・応相談）を公開しています。FAQでは市場工場の貸室が1室 月7万円です。
- 市場内の冷蔵庫——北九州市中央卸売市場付属の冷蔵庫です。SF級240tの超低温室があります。
- 定温にも対応——葛葉埠頭工場に+5〜+20℃の定温室があります。野菜・天津甘栗なども保管しています。
拠点とサービスの内容
| 所在地 | 福岡県北九州市門司区大里本町2丁目11番3号 |
|---|---|
| 拠点のある地域 | 福岡県に冷凍・冷蔵の拠点 |
| 対応品目 | 冷凍魚、野菜、冷凍食品、冷凍貨物（本社工場）、冷凍魚（市場工場）、冷凍魚・野菜・天津甘栗（葛葉埠頭工場）。貸室は生鮮品・冷凍品・加工品・工業薬品にも使える。危険物・重量物は不可 |
| サービスの型・温度帯 | 寄託。公式FAQ「0℃から-40℃までカバー」。本社工場 F級（一部C級）、市場工場 SF級・F級・C級、葛葉埠頭工場 F級・C級（2001年に1室を定温倉庫に切替）。貸室の設定可能温度：本社16号・19号 0℃～-20℃、葛葉57号 +5℃～+20℃。協会データ：市場工場にF3・F4（-40℃以下）600㎥ |
| 拠点数・設備能力 | 総収容能力：本社工場2,353t、市場工場6,354t（うちSF級240t）、葛葉埠頭工場3,116t。3工場の合計11,823t（当方集計） |
| 料金の公表 | 貸倉庫のご案内：本社工場16号倉庫（縦6.8m×横2m×高さ2.5m・0℃～-20℃）月8万円、19号倉庫（縦6.4m×横6.4m×高さ5m）月14万円、葛葉埠頭工場57号倉庫（縦3.1m×横4.3m×高さ2.3m・+5℃～+20℃）月5万円（いずれも応相談・税別。警備解除キー代・荷役料は別途）。FAQ：市場工場の貸室は1室月7万円。寄託（倉庫に預ける場合）の料金は公表されていません |
こんな人に向いています：北九州で24時間自分で出し入れできる冷凍庫を借りたい事業者、市場関係の水産品、定温保管が必要な荷主に向いています。
超低温の冷凍保管で確認したいこと：寄託（預ける場合）の料金、貸室の空き、警備解除キー代、SF級の温度設定を確認してください。
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超低温の冷凍保管について各社の公式サイトで確認できた記載
当サイトが確認したページに、この品目・利用方法に関する記載があった会社だけを挙げています。表現は各社の公式サイトの記載に沿っています。
| 会社名 | 公式サイトで確認できた記載（2026年9月12日確認） |
|---|---|
| 横浜冷凍株式会社 | 拠点ごとの室別保管温度のPDFで、SF級の室を持つ拠点を公開。横浜物流センター・北港物流センター（SF1級）、大井川物流センター（SF1・SF2・SF4級）など |
| Umios ロジ株式会社 | 冷蔵室ごとの保管温度一覧で、成田事業所に−60℃、川崎第二物流センターに−55℃、築港物流センターに−50℃の室（SF4級） |
| 株式会社SIC LOGITEC（旧 焼津冷凍） | 超低温−60℃（SF4）の倉庫を静岡県中部の2拠点（藤枝センター、2026年春稼働開始の吉田センター）で運営し、超低温の収容は合計17,600トン。品目はマグロ・カツオ・カジキ・その他加工品と案内 |
| 株式会社兵食 | 神戸港の五突冷蔵庫にSF級−55℃の室（アンモニア冷媒・収容1,000トン）。兵庫県内の7庫すべてが保税蔵置場・動物検疫指定倉庫 |
| 門司冷凍製氷株式会社 | 北九州市中央卸売市場内の市場工場にSF級の室（収容240トン）。公式FAQで「0℃から−40℃までカバー」と案内 |
上表は2026年9月12日に各社の公式サイトを確認した時点の記載です。全国10社では横浜冷凍・Umios ロジの2社、都道府県別の調査で確認した地場の事業者ではSIC LOGITEC（静岡県）・兵食（兵庫県）・門司冷凍製氷（福岡県）の3社が、超低温の室を公式サイトで公開していました。
超低温（SF級）の冷凍倉庫の区分と規模
超低温の冷凍倉庫とは、保管温度が−35℃以下の冷蔵室（SF級）を持つ倉庫のことです。国土交通省の告示では、令和6年4月1日施行の改正でSF1級（−40℃を超え−35℃以下）からSF4級（−50℃以下）までの4区分が設けられました。改正前に登録された倉庫は旧区分のまま扱われ、旧区分ではF2級（−40℃を超え−30℃以下）のうち−35℃以下の部分と、F3級（−50℃を超え−40℃以下）・F4級（−50℃以下）が、新区分のSF級の温度にあたります。
| 地域 | SF級の所管容積（㎥） | 容積に占めるSF級の比率 | SF級の室を持つ事業所 |
|---|---|---|---|
| 静岡県 | 約62万 | 57.3% | 52 |
| 神奈川県 | 約26万 | 5.8% | 17 |
| 北海道 | 約18万 | 14.4% | 22 |
| 愛知県 | 約12万 | 7.3% | 13 |
| 全国 | 1,535,676 | 5.1% | — |
超低温の冷蔵室は地域に偏っています。静岡県は会員の冷蔵倉庫の容積の過半がSF級で、全国のSF級の容積の約4割が静岡県にあります。預けたい品目が超低温なら、配送先との距離に加えて、超低温の室が多い地域から候補を探すと効率的です。
参照：日本冷蔵倉庫協会「都道府県別 所管容積・製氷・凍結一覧」（2025年12月31日現在・会員の営業用倉庫のみ。地域別の容積は当サイトが同データから算出し、万単位で丸めた）、国土交通省「倉庫業法第三条の登録の基準等に関する告示」と改正の報道発表（令和6年1月31日）（いずれも2026年9月12日確認）。
超低温の品目を預けるときに確認すること
超低温の保管先は、温度が合うかどうかだけでは決まりません。室の空き、凍結の能力、輸入品なら保税と検疫の指定、そして保管料の割増の4点を、問い合わせの最初に確かめてください。
| 確認すること | 理由 |
|---|---|
| 室の保管温度（℃） | SF級は区分が細かく、同じSF級でも−35℃台と−60℃では用途が違う。旧区分で登録された倉庫もある |
| 空き状況と入庫の時期 | 超低温の室は数が限られるため、水揚げの時期や輸入のタイミングに受け入れられるかを先に確認する |
| 凍結の能力 | 水揚げした品を凍らせてから保管する場合は、凍結の能力（1日あたりのトン数）がある拠点か |
| 保税・通関・動物検疫 | 輸入のマグロ・畜産品は、保税蔵置場や動物検疫の指定がある拠点が便利 |
| 保管料の割増 | 超低温の保管は料率が割増になる場合がある。神洋冷凍の保管料率表は、−30℃以下−40℃未満の保管をF級料率の10割以内、−40℃以下を20割以内の割増としている |
超低温の室は、冷凍食品向けのF級の室と比べて数が限られます。拠点ごとの室の温度を公開している事業者（掲載社では横浜冷凍・Umios ロジ・SIC LOGITEC・兵食）から当たり、公開していない事業者には必要な℃を伝えて確かめてください。見積もりでは、F級の料率に対する割増の率も確認します。
参照：横浜冷凍・Umios ロジの保管温度一覧、SIC LOGITEC・兵食・門司冷凍製氷の公式サイト、神洋冷凍「冷蔵倉庫保管料率表」（いずれも2026年9月12日確認）。
料金と法令は必ず一次情報で確認してください
本ページに記載した料金・拠点・温度の数値は、各社が公式サイトで公表しているもので、預ける量・期間・荷姿によって変わります。自社の料金は、条件を伝えたうえでの見積もりで確認してください。法令・制度の記載は全体像を示すための要約で、個別の判断は条文と所管窓口でご確認ください。
超低温の冷凍保管の保管に関するよくある質問
マグロは何℃の冷凍倉庫で保管しますか？
品目と用途によって保管温度が違うため、当サイトでは一律の温度を示していません。冷蔵倉庫の温度級では、−35℃以下の室がSF級にあたり、Umios ロジは成田事業所に−60℃の室を持つと公開しています（2026年9月12日確認）。必要な温度は荷主側の品質基準で決め、その℃に対応する室があるかを確認してください。
超低温の冷凍倉庫が多い地域はどこですか？
日本冷蔵倉庫協会の公表データ（2025年12月31日現在・会員のみ）では、静岡県が最も多く、容積の57.3%がSF級で、SF級の室を持つ事業所が52あります。次いで神奈川県・北海道・愛知県にSF級の室を持つ事業所がまとまっています。
SF級とF級の違いは何ですか？
保管温度の区分の違いです。国土交通省の告示（令和6年4月1日施行の区分）では、F1〜F3級が−18℃以下〜−35℃を超える範囲、SF1〜SF4級が−35℃以下の範囲です。改正前に登録された倉庫は旧区分（F1〜F4級）のまま扱われるため、級の名前ではなく℃で確認してください。
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この記事を書いた人
執筆・編集：冷凍倉庫ナビ 編集部
冷凍・冷蔵品を外部の倉庫に預けたい企業のために、全国と都道府県別に、冷凍冷蔵倉庫の事業者の温度帯・拠点・対応品目・利用条件を公式情報にもとづいてまとめています。
最終更新：2026年9月12日